se vc clikou em escrever dados, e o programa começou a ler os dados e no fim apareceu operação concluída, o backup foi feito perfeitamente.
os backups ficam salvos na pasta "backups" dentro da pasta em q o flash&backup foi instalado, nos arquivos de programas. o endereço padrão é o seguinte: C:\Arquivos de programas\Motorola Tools\Flash&Backup 3\Backups
va nessa pasta e confira se há dentro dela uma outra pasta com a data do dia q vc fez o backup. se sim, confira dentro desta segunda pasta se seu backup está lá (o nome dele será a data e a hora do backup, mais a extenção q voce escolheu para ele tipo fb3, shx, etc.).
espero ter ajudado!